Futbolu bıraktıktan sonra Ertuğrul Sağlam'ın ekibinde de yer alan Ömer Erdoğan bundan sonra kariyerine yeni bir sayfa açtığını duyurdu. Ömer Erdoğan kişisel sosyal paylaşım hesabından yaptığı açıklamada kendi kariyer planlaması doğrultusunda Ertuğrul Sağlam ile yollarını ayırdığını açıkladı.
Oyunuyla herkesin takdirini kazanan başarılı oyuncu, Bursaspor'da kaptanlığa kadar yükselmiş ve A Milli Takım'a seçilmişti. 13 Mayıs 2013 tarihinde Bursa'da oynanan Bursaspor-Eskişehirspor maçı ile aktif futbol yaşantısına son vererek futbolu Bursaspor'da bıraktığından beri antrenörlük ile uğraşıyor.